U Sektoru za željeznički saobraćaj, obavljaju se poslovi razvojne i normativno pravne prirode, kao i poslovi tehničke operative kroz praćenje izvedenih radova na željezničkoj infrastrukturi i to poslovi koji se odnose na izradu strategije razvoja željezničkog saobraćaja; izradu nacrta zakona, podzakonskih akata, tehničkih i drugih propisa, normativa, standarda i sporazuma u oblasti željezničkog saobraćaja; izradu prijedloga mjera za realizaciju utvrdjene strategije razvoja željezničkog saobraćaja; izdavanje licenci, sertifikata, dozvola i saglasnosti iz nadležnosti Direkcije i vodjenja evidencije o istim; odlučivanje po prigovorima protiv odbijene ili izmjenjene ili dopunjene ponude za zaključenje ugovora o korišćenju željezničke infrastrukture; harmonizaciju nacionalnih sa medjunarodnim propisima iz oblasti željezničkog saobraćaja; davanje mišljenja na planove i programe željezničkih preduzeća u kojima Republika Crna Gora ima vlasničkog udjela; učešće u obezbjedjivanju medjunarodnih kredita i nadzor nad njihovom realizacijom; pripremanje pravnih mišljenja, informacija, analiza i prijedloga mjera; praćenje razvoja tehničkih i tehnoloških sistema željeznica u drugim zemljama i predlaganje mjera u cilju harmonizacije, povećanja nivoa interporabilnosti i modernizacije; ostvarivanje međunarodne saradnje u oblasti željezničkog saobraćaja i njeno unapredjenje; izradu i objavljivanje svih prevoznih isprava, dokumenata i obrazaca iz mejdunarodnog putničkog i robnog saobraćaja, a koji se odnose na ugovor o prevozu, transportno manipulativni postupak kao i primopredaju izmedju željeznica, odnosno transportnih preduzeća; praćenje stanja bezbjednosti u željezničkom saobraćaju, analiza pojava i predlaganje sistemskih mjera u cilju prevencije nastajanja vanrednih dogadjaja, zatim poslovi koji se odnose na stručnu kontrolu nad izvodjenjem radova na gradjenju, rekonstrukciji, održavanju i zaštiti željezničke infrastrukture, zatim poslovi oko izgradnje i rekonstrukcije željezničke infrastrukture kao i njihovo redovno održavanje, zatim poslovi vezani za pripremu poziva za nadmetanje i zaključivanje ugovora za: izradu tehničke dokumentacije, izvodjenje radova na izgradnji i rekonstrukciji željezničke infrastrukture, zaključivanje ugovra za redovno i investiciono održavanje infrastrukture, praćenje izvodjenja navedenih radova, prijem i predaja izvedenih radova, izrada izvještaja i informacije za potrebe nadležnih organa, izrada prethodnih studija i studija opravdanosti za izgradnju i rekonstrukciju željezničke infrastrukture, vodjenje evidencije o nepokretnosti koje pripadaju željezničkoj infrastrukturi, arhiviranje tehničke dokumentacije i druge odgovarajuće poslove. Ovi poslovi se obavljaju kroz dva odsjeka:

- U odsjeku za razvojne, normativno pravne poslove, obavljaju se poslovi koji se odnose na izradu strategije razvoja željezničkog saobraćaja; izradu nacrta zakona, podzakonskih akata, tehničkih i drugih propisa, normativa, standarda i sporazuma u oblasti željezničkog saobraćaja; izradu prijedloga mjera za realizaciju utvrdjene strategije razvoja željezničkog saobraćaja; izdavanje licenci, sertifikata, dozvola i saglasnosti iz nadležnosti Direkcije i vodjenja evidencije o istim; odlučivanje po prigovorima protiv odbijene ili izmjenjene ili dopunjene ponude za zaključenje ugovora o korišćenju željezničke infrastrukture; harmonizaciju nacionalnih sa medjunarodnim propisima iz oblasti željezničkog saobraćaja; davanje mišljenja na planove i programe željezničkih preduzeća u kojima Republika Crna Gora ima vlasničkog udjela; učešće u obezbjedjivanju medjunarodnih kredita i nadzor nad njihovom realizacijom; pripremanje pravnih mišljenja, informacija, analiza i prijedloga mjera; praćenje razvoja tehničkih i tehnoloških sistema željeznica u drugim zemljama i predlaganje mjera u cilju harmonizacije, povećanja nivoa interporabilnosti i modernizacije; ostvarivanje medjunarodne saradnje u oblasti željezničkog saobraćaja i njeno unapre-djenje; izradu i objavljivanje svih prevoznih isprava, dokumenata i obrazaca iz mejdunarodnog putničkog i robnog saobraćaja, a koji se odnose na ugovor o prevozu, transportno-manipulativni postupak kao i primopredaju izmedju željeznica, odnosno transportnih preduzeća; praćenje stanja bezbjednosti u željezničkom saobraćaju, analiza pojava i predlaganje sistemskih mjera u cilju prevencije nastajanja vanrednih dogadjaja.

- U odsjeku tehničke operative,  obavljaju se poslovi koji se odnose na stručnu kontrolu nad izvodjenjem radova na gradjenju, rekonstrukciji, održavanju i zaštiti željezničke infrastrukture, zatim poslovi oko izgradnje i rekonstrukcije željezničke infrastrukture kao i njihovo redovno održavanje, zatim poslovi vezani za pripremu poziva za nadmetanje i zaključivanje ugovora za: izradu tehničke dokumentacije, izvodjenje radova na izgradnji i rekonstrukciji željezničke infrastrukture, zaključivanje ugovra za redovno i investiciono održavanje infrastrukture, praćenje izvodjenja navedenih radova, prijem i predaja izvedenih radova, izrada izvještaja i informacije za potrebe nadležnih organa, izrada prethodnih studija i studija opravdanosti za izgradnju i rekonstrukciju željezničke infrastrukture, vodjenje evidencije o nepokretnosti koje pripadaju željezničkoj infrastrukturi, arhiviranje tehničke dokumentacije i druge odgovarajuće poslove.